企业在取得不合规发票时，应采取以下措施进行处理：

1.不得作为税前扣除凭证：企业取得的不合规发票，如私自印制、伪造、变造、作废、开票方非法取得、虚开、填写不规范等，不得作为税前扣除的凭证。

2.要求补开或换开：如果企业应当取得而未取得发票，或取得的是不合规发票，且支出真实且已实际发生，应在当年度汇算清缴期结束前，要求对方补开或换开发票，以符合规定的发票作为税前扣除凭证。

3.税务机关检查后的补救措施：如果在汇算清缴期结束后，税务机关发现企业应取得而未取得发票或取得不合规发票，并告知企业，企业应自被告知之日起60日内补开或换开符合规定的发票。如果因对方特殊原因无法补开或换开，企业应提供可以证实其支出真实性的相关资料。

4.追补扣除：对于以前年度的支出，如果因未取得合规凭 ……